Яна Сексте родилась в Риге, а об актерской карьере стала задумываться уже в старших классах. В 14 лет она начала посещать театральную студию, после окончания школы переехала в Москву, где стала студенткой МХАТа на курсе Олега Табакова. Режиссер отметил необычную и самобытную внешность актрисы и пророчил ей большое будущее.
Сразу после окончания вуза Яна вернулась на родину и была зачислена в труппу Рижского русского театра. По результатам опроса зрителей, она стала лучшей молодой актрисой театра за сезон 2003-2004 годов. В 2005 году она снова перебралась в Москву и устроилась в театр-студию Олега Табакова.
Дебют Яны Сексте в кино произошел годом позже. Актриса снялась в эпизодической роли в телефильме «Алмазы на десерт». Затем последовало несколько лет неудач в карьере: то кинокартины были откровенно слабыми, то актрису брали только на вторые роли.
Яне удалось показать себя как талантливую актрису лишь в 2011 году, когда она снялась в телесериале «Оттепель». После этого публика все-таки запомнила Сексте, и актрису стали приглашать на более заметные роли. Она снялась в таких кинопроектах, как «Чудотворец», «Город», «Следователь Тихонов», «Сердце мира». Всю себя Яна отдает любимому театру, а карьера на телевидении для нее имеет второстепенную важность.
Личная жизнь актрисы сложилась не сразу. Со своим первым супругом, актером Максимом Матвеевым, звезда познакомилась во время работы над спектаклем «Сорок первый». Красавец покорил ее сердце, и в 2008 году они поженились. Этот брак просуществовал всего год. Во время съемок фильма «Не скажу» Матвеев познакомился с Елизаветой Боярской, и у них закрутился роман. Актер не стал скрывать свои отношения, честно признался супруге, после чего последовал развод.
Яна тяжело восприняла уход мужа: мало спала, почти ничего не ела, впала в депрессию. По словам самой актрисы, у нее даже были мысли о том, чтобы свести счеты с жизнью. Однако она вовремя настроилась на нужный лад, всю себя отдала работе. Наградой за страдания стала встреча со вторым супругом, композитором Дмитрием Мариным. Вместе семейная пара живет с 2013 года, воспитывает дочь Анну.
Сейчас Яна Сексте счастлива в браке, о прошлом старается не вспоминать, хотя ей и приходится работать с бывшим супругом в благотворительном фонде помощи детям «Доктор Клоун». Позднее к фонду присоединилась и Лиза Боярская – актрисы смогли найти общий язык и даже подружились.